Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ttc17E9PVB5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ttc17E9PVB5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms