Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ifit3bE9PV48 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ifit3bE9PV48 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms