Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syde2E9PUP1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syde2E9PUP1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms