Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccnb1ip1D3Z3K2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms