Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tpm3-rs7D3Z2H9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms