Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf217D3YYI7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf217D3YYI7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf217D3YYI7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf217D3YYI7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf217D3YYI7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf217D3YYI7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf217D3YYI7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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