Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam47eD3YWC7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms