Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc13D3YV10 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc13D3YV10 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms