Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smok3bC0HKC9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms