Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ57

Mterf1b, Transcription termination factor 1b, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1bB9EJ57 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mterf1bB9EJ57 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms