Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Phf11bB4XVQ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Phf11bB4XVQ1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms