Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usf3B2RUQ2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usf3B2RUQ2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usf3B2RUQ2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usf3B2RUQ2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Usf3B2RUQ2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Usf3B2RUQ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Usf3B2RUQ2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usf3B2RUQ2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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