Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prrt4B2RU40 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prrt4B2RU40 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms