Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apol7aB2RT54 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Apol7aB2RT54 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms