Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpb1B2RS76 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cpb1B2RS76 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cpb1B2RS76 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cpb1B2RS76 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cpb1B2RS76 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpb1B2RS76 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms