Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ythdc2B2RR83 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ythdc2B2RR83 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms