Protein–RNA interactions for Protein: B1AY10

Nfx1, Transcriptional repressor NF-X1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfx1B1AY10 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nfx1B1AY10 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nfx1B1AY10 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms