Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NhsB1AV60 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NhsB1AV60 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms