Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trabd2bB1ATG9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trabd2bB1ATG9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trabd2bB1ATG9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trabd2bB1ATG9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms