Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spocd1B1ASB6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms