Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttll11A4Q9F4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms