Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Odf2A3KGV1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Odf2A3KGV1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms