Protein–RNA interactions for Protein: A2BFE8

Prrg1, Proline-rich Gla (G-carboxyglutamic acid) 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg1A2BFE8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prrg1A2BFE8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrg1A2BFE8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrg1A2BFE8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrg1A2BFE8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrg1A2BFE8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrg1A2BFE8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrg1A2BFE8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prrg1A2BFE8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms