Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef25A2ASI9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms