Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtcflA2APF3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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