Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Frmpd1A2AKB4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Frmpd1A2AKB4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Frmpd1A2AKB4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms