Protein–RNA interactions for Protein: A2AJW4

Ppp1r3d, Protein phosphatase 1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3dA2AJW4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ppp1r3dA2AJW4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ppp1r3dA2AJW4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms