Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ccdc183A2AJB1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc183A2AJB1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms