Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pramef6A2A8M8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Pramef6A2A8M8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pramef6A2A8M8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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