Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkd2l1A2A259 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd2l1A2A259 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms