Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nlrp1bA1Z198 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nlrp1bA1Z198 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms