Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
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