Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trbv26A0A0B4J1P5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms