Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trbv1A0A0B4J1G7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Trbv1A0A0B4J1G7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trbv1A0A0B4J1G7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv1A0A0B4J1G7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trbv1A0A0B4J1G7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv1A0A0B4J1G7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv1A0A0B4J1G7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trbv1A0A0B4J1G7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv1A0A0B4J1G7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv1A0A0B4J1G7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv1A0A0B4J1G7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trbv1A0A0B4J1G7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Trbv1A0A0B4J1G7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trbv1A0A0B4J1G7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Trbv1A0A0B4J1G7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Trbv1A0A0B4J1G7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Trbv1A0A0B4J1G7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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