Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm28490A0A087WRT9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm28490A0A087WRT9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms