Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trav4-2A0A075B638 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trav4-2A0A075B638 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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