Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
RFTN1Q14699 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms