Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
E2F1Q01094 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
E2F1Q01094 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms