Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
ALCAMQ13740 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms