Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vstm4T1NXB5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms