Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Robo3Q9Z2I4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Robo3Q9Z2I4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms