Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mbd3Q9Z2D8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms