Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ube2aQ9Z255 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms