Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NfkbiaQ9Z1E3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NfkbiaQ9Z1E3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms