Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Sh3bp5Q9Z131 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Sh3bp5Q9Z131 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Sh3bp5Q9Z131 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Sh3bp5Q9Z131 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Sh3bp5Q9Z131 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Sh3bp5Q9Z131 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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Sh3bp5Q9Z131 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Sh3bp5Q9Z131 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sh3bp5Q9Z131 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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Sh3bp5Q9Z131 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp5Q9Z131 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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