Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb6Q9Z0T9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb6Q9Z0T9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms