Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cldn13Q9Z0S4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn13Q9Z0S4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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