Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Oc90Q9Z0L3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Oc90Q9Z0L3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms