Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pacsin2Q9WVE8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pacsin2Q9WVE8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms