Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VapaQ9WV55 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms